消毒是春季羊驼场工作的重点，特别是在春季逐渐上升的气温，会使多种病原微生物复苏并大量的繁殖，所以应加强春季的消毒工作。
清理好羊驼场及舍内的环境卫生，将场内的污物、垃圾以及舍内的粪尿及时的处理干净。每个圈舍的门口都要设置消毒盆，消毒液可以选择2%～3%的火碱或3%～5%的来苏儿，进出圈舍的人员必须更换专门的靴子和工作服后经消毒盆消毒后再进舍，并且盆内的消毒液要每天进行更换。
羊驼场的门口要设置消毒池，进出的车辆要经过消毒池后才能进入场区内，池内的消毒液要及时更换。
在消毒药剂的使用时，要避免两种或多种消毒药交替使用，同时也要避免长时间使用一种消毒药剂，以免产生抗药性。
一般情况下，畜、禽圈舍无需消毒，定期通风换气、做好卫生清整即可。
在当地或附近发生动物传染病时，可在加强通风换气的基础上，视情采取必要的消毒措施。
对各种表面（地面、墙面、护栏等），可喷洒或擦拭化学消毒剂（84消毒液、过氧乙酸、漂白粉上清液等），作用30分钟后，使用清水抹布（墩布）将残留的消毒剂除净，即可。
潮湿的地面，也可直接撒布漂白粉、生石灰等。
一般先用扫帚清扫并用水冲洗干净后，再用消毒液消毒。用消毒液消毒的操作步骤如下。
(一）消毒液选择与用量
常用的消毒药有10%〜20%石灰乳、30%漂白粉、0。5%〜 1%菌毒敌（原名农乐，同类产品有农福、农富、菌毒灭等）、 0。 5%〜1%二氯异氰尿酸钠（以此药为主要成分的商品消毒剂有强 力消毒灵、灭菌净等）、0。
5%过氧乙酸等。消毒液的用量，以羊驼舍内每平方米面积用1升药液配制，根据药物用量说明来计算。
(二）消毒方法
将消毒液盛于喷雾器内，喷洒圈舍、地面、墙壁、天 花板，然后再开门窗通风，用清水刷洗伺槽、用具等，将消毒药味 除去。如羊驼舍有密闭条件，可关闭门窗，用福尔马林熏蒸消毒12〜 24小时，然后开窗24小时。
福尔马林的用量是每平方米空间12。 5〜 50毫升，加等量水一起加热蒸发。在没有热源的情况下，可加人等 量的高锰酸钾（每平方米用7〜25克），即可反应产生高热蒸汽。
(三）空羊驼舍消毒规程
育肥羊驼出栏后，先用0。5%〜1%菌毒杀对羊驼舍消毒，再清除 羊驼粪。
3%火碱水喷洒舍内地面，0。5%过氧乙酸喷洒墙壁。打扫完 羊驼舍后，用0。5%过氧乙酸或30%漂白粉等交替多次消毒，每次间 隔一天。
消毒工作是养殖场做好防疫工作的一个非常重要的措施，也是一项系统性技术性工作，通过消毒，可以达到杀灭和抑制场区病原微生物传播的目的。但实际工作中，相当一部分养殖场仍然对消毒不够重视、认识不充分，在进行消毒工作的过程中往往会粗枝大叶，急于求成，出现一些误区需要特别注意
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